O procedimento transcorre com a paciente sentada ou deitada numa maca, com a mama instalada no aparelho de mamografia e comprimida, para que mantenha sempre a mesma posição, sem qualquer deslocamento da mama.

O médico localiza a alteração com as radiografias obtidas na hora, e ajusta o equipamento para saber o local exato que irá realizar a biópsia. Após isto, é feita a anestesia local e é realizada a biópsia de fragmentos.

A estereotaxia serve para diagnosticar tumores quase invisíveis. Com esse equipamento, é possível ainda definir a área, os detalhes de borda e de contraste do nódulo.